Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
ARL2-SNX15V9GYD0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms