Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PKP3Q9Y446 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms