Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KDM2AQ9Y2K7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms