Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TRAPPC4Q9Y296 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TRAPPC4Q9Y296 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms