Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAK1Q9UPV9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAK1Q9UPV9 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms