Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA2

FBXL4, F-box/LRR-repeat protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL4Q9UKA2 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FBXL4Q9UKA2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms