Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms