Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CPA4Q9UI42 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms