Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGXB4Q9UGU5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms