Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HACD3Q9P035 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms