Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms