Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CHST12Q9NRB3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms