Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ40

SLC52A3, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A3Q9NQ40 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC52A3Q9NQ40 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms