Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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FANCFQ9NPI8 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FANCFQ9NPI8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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