Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A4GALTQ9NPC4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms