Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SSU72Q9NP77 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SSU72Q9NP77 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms