Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HMG20AQ9NP66 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HMG20AQ9NP66 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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HMG20AQ9NP66 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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