Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CENPJQ9HC77 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms