Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
POLR2J2Q9GZM3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms