Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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FOXQ1Q9C009 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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