Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SLC4A5Q9BY07 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SLC4A5Q9BY07 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms