Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRRTQ9BXP5 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRRTQ9BXP5 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms