Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CARD11Q9BXL7 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms