Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
SMAD5Q99717 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SMAD5Q99717 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms