Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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PKP4Q99569 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PKP4Q99569 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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