Protein–RNA interactions for Protein: Q96SW2

CRBN, Protein cereblon, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRBNQ96SW2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CRBNQ96SW2 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CRBNQ96SW2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms