Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NSMCE2Q96MF7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms