Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SENP8Q96LD8 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms