Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRRIQ1Q96JM4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
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