Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDK5RAP3Q96JB5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms