Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SCMH1Q96GD3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SCMH1Q96GD3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms