Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
MVB12AQ96EY5 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms