Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NMD3Q96D46 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.9 ms