Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CTHRC1Q96CG8 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CTHRC1Q96CG8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms