Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms