Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms