Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOMQ8WWX9 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SELENOMQ8WWX9 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SELENOMQ8WWX9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms