Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TMIEQ8NEW7 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TMIEQ8NEW7 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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TMIEQ8NEW7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TMIEQ8NEW7 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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TMIEQ8NEW7 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMIEQ8NEW7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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