Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC84Q86UT8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC84Q86UT8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms