Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP54Q7Z3B4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms