Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms