Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW02

CYP20A1, Cytochrome P450 20A1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP20A1Q6UW02 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CYP20A1Q6UW02 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CYP20A1Q6UW02 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms