Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TUBA3EQ6PEY2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms