Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6P435 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6P435 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6P435 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6P435 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6P435 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Q6P435 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Q6P435 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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