Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ1

RPGRIP1L, Protein fantom, humanhuman

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1LQ68CZ1 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPGRIP1LQ68CZ1 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RPGRIP1LQ68CZ1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms