Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RIF1Q5UIP0 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms