Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms