Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CCDC38Q502W7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC38Q502W7 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms