Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DUSP28Q4G0W2 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms