Protein–RNA interactions for Protein: Q32P28

P3H1, Prolyl 3-hydroxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H1Q32P28 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P3H1Q32P28 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms